以项目为核心业务，那么对项目型的公司组织形式来说，也必须符合项目的特点和管理方法，下面介绍三个方式来对项目型公司进行组织评价。
一、使用五九矩阵评价组织的项目管理职能
五大过程和九大知识领域是每个项目管理者熟知的内容，五九矩阵就是以五大过程和九大知识领域为横、纵坐标，列出企业所涉及项目在每个阶段每个管理内容中相对应的管理点。
当然，这45个交叉点，并不一定都有相应的管理内容与之对应，但这个矩阵提供了一个非常简单有效的方法，来判断组织在相应的项目管理职能上是否有所遗漏。
图1-项目型公司职能评价“五九”矩阵
二、评价项目管理组织
五九矩阵对于单个项目的管理内容是有效的。但对于企业来说，还缺少企业级的项目管理内容。我们都知道，PMO是很多企业采用的对多个项目管理的组织形式之一，但对于更多的公司，通常还是以常见的矩阵方式存在，而公司的领导班子（或高管会议）通常成为多个项目管理时的决策层，相当于PMO的角色，对多个项目之间的资源分配，项目投资以及项目整体绩效进行决策。
职能部门在项目型公司的地位则较为特殊，和常规企业不同，项目型公司的核心职能部门通常由富有经验的前项目人员构成，他们必须也只有在具备丰富项目运作经验的基础上，才可能对正在运作的项目提供有效的技术、业务指导。
因此我们认为，在项目型公司普遍存在着对项目的“三级管控模式”。职能部门在此间充当着相当重要的角色，职能部门对项目介入的深浅程度，以及职能部门对项目所拥有的权限，决定了组织整体的形式是属于强矩阵式还是弱矩阵式。对于项目经理更为强势的强矩阵，效率更高但风险也相应地增加，对于职能部门更为强势的弱矩阵，则较好地控制了风险，但相应地项目的运作效率也会一定程度降低。
