马云将责任归结为违背公司价值观，由公司经营管理层承担全部责任，在一场公关达人秀后，阿里巴巴的诚信危机得到了缓和，但是这掩盖不了阿里巴巴内部控制管理缺陷。
一、阿里巴巴的内控危机始于董事会
第一，阿里巴巴内部控制的最高管理机构为上市公司董事会
按照国家内部控制规范的要求，董事会是内部控制的最高管理机构，而阿里巴巴董事会也成立了审核委员会等四大委员会，主要负责协助董事会就财务报告程序、内部监控及风险管理制度的有效性提供独立意见，并强调审核委员会定期召开会议，以检讨财务报告、内部监控及风险管理事宜，阿里巴巴从内部也明确了董事会关于内部控制管理的责任。
阿里巴巴的主营业务是B2B电子商务，而电子商务有三个阶段，即交易机会，交易确认和交易执行。阿里巴巴主要是做交易机会的，交易机会中最为关键是交易信息与诚信问题，所以诚信问题是阿里巴巴的重大控制点，事关公司生存的风险点没有管理好，两年之后才发现，董事会须负有不可推卸的责任。
第二，阿里巴巴发展战略的选择导致了本次危机的产生
阿里巴巴2007年11月成功上市以来，主要借助最大规模的供给信息，通过会员服务、开展企业信用认证、关键字竞争搜索收费是阿里巴巴的主要盈利模式。受2008年金融危机的影响，阿里巴巴率先抛出“过冬论”，股价也跌倒最低（见图一）。为提升客户数量，2008年11月，在“中国供应商”体系下推出了一款低价产品出口通，该产品刚推出的价格是1.98万元，而此前中国供应商的价格为5万元人民币。受此政策影响，2009年中国供应商数量增长123%，净增用户大约53000个，增加收入10.5亿人民币，同年阿里巴巴营业利润10.7亿人民币，如果没有这个因素的影响，阿里巴巴的很可能会陷入亏损（主要财务数据见表一）。正是因为董事会的决策，该降价举措才帮助阿里巴巴渡过了金融危机，也为今天的诚信危机埋下伏笔。
图一：阿里巴巴股价走势图
